Istnieje kilka metod dezynfekcji wody w basenie, które różnią się sposobem działania i intensywnością. Najczęściej stosowane to chlorowanie, dezynfekcja promieniowaniem UV, ozonowanie oraz automatyczne systemy dozowania chemii. Chlorowanie to tradycyjna i skuteczna metoda, która eliminuje bakterie, glony i wirusy. Lampa UV działa bez użycia chemii, niszcząc mikroorganizmy za pomocą światła ultrafioletowego. Ozonowanie natomiast wykorzystuje ozon jako silny utleniacz, który usuwa zanieczyszczenia organiczne. W nowoczesnych basenach VIVAPOOL często łączy się różne metody, aby uzyskać maksymalną skuteczność i najwyższy komfort kąpieli.